El Instituto cuenta con instalaciones y mobiliario en buen estado: en la planta baja el área de estacionamiento, dos bodegas, dos laboratorios de Arqueología, uno de Bioarqueología y una sala de juntas.
En el primer nivel se encuentran las áreas de la dirección y administración, sala de
exposiciones temporales, sanitarios, biblioteca Dr. Gonzalo Aguirre Beltrán y el Archivo documental.
En el segundo nivel se encuentra el área de cubículos (39) y una sala de juntas.
- Dirección
- Administración
- Sala de usos múltiples
- Biblioteca Dr. Gonzalo Aguirre Beltrán
- Biblioteca Dr. Gonzalo Aguirre Beltrán
- Sanitarios
- Espacio de usos múltiples
- Laboratorio de Bioarqueología
- Laboratorio de Arqueología
- Laboratorio de Arqueología
- Sala de juntas
- Estacionamiento
- Área de cubículos
- Área de cubículos
- Área de cubículos