El trabajo académico del OABCC, se centra en diversas temáticas estratégicas mismas que implican el desarrollo de enfoques relacionados con sistemas complejos, interdisciplinarios, hidrogeográficos, entre otros, mediante procesos de investigación articulados con la formación de recursos humanos; el contexto se ubica en espacios territoriales de cuencas y costas del estado de Veracruz, a continuación se exponen éstas:
- Disponibilidad de agua en cuanto a la cantidad del recurso de cuerpos naturales y fuentes de abastecimiento en contextos rurales y urbanos; así como a la calidad en relación de parámetros relacionados con los materiales pesados, químicos y microbiológicos, y métodos de tratamiento de agua, entre otros.
- Calidad del suelo y de la problemática que se deriva entre la relación de la calidad del suelo y calidad del agua,
- Condición ecológica de los arrecifes coralinos del PNSAV en aguas someras y aguas profundas mediante percepción remota óptica y acústica.
- Impactos y afectaciones del factor antrópico a los ecosistemas y sus servicios ambientales, por las actividades de los usuarios del agua, cambio de uso del suelo, uso no racional de los recursos naturales, entre otros, mismos que alteran los procesos de los ecosistemas terrestres y acuáticos.
- Caracterización y conservación de recursos biológicos en ambientes antropizados, y ecología de la conservación y restauración.
- Diseño y desarrollo de metodologías que permitan medir la resiliencia de los sistemas ecohidrológicos.
- Peligro y riesgo de los ecosistemas hídricos y vulnerabilidad social de la población.