(1980) Inicia una serie de estudios sobre una colonia de macacos en una isla de la Laguna de Catemaco, Veracruz. Fundando el Centro de Investigaciones Biológicas con otros dos investigadores. Desde ese momento funge como Coordinador de dicho Centro.
(1984) Con el apoyo de la Secretaria de Educación Pública y de la Secretaria de Programación y Presupuesto (COSSIES) logra un crecimiento institucional significativo (plazas de investigadores y técnicos, equipo y materiales diversos) en el CIB, creando un amplio programa: Estudios florísticos y faunísticos en la Sierra de Santa Martha (Veracruz, México).
(1985) Inicia la creación del «Parque de la flora y fauna silvestre tropical» en la Región de Los Tuxtlas, Veracruz.
(1986) Es nombrado Jefe del Centro de Investigaciones Biológicas.
(1988) Logra el establecimiento del «Parque» en Catemaco, Veracruz, sobre un terreno de bosques tropicales de aproximadamente 220 has.Con el apoyo del Patronato Pro- Universidad Veracruzana y financiamiento de Instituciones internacionales se crea una infraestructura básica para la investigación y la enseñanza. Se maneja una colección importante de animales,lo cual constituye un valioso patrimonio universitario.
(1990) El «Parque» desarrolla una notable actividad en la investigación y la enseñanza, incorporando un número creciente de colaboradores al estudio y conservación de la vida silvestre de la Región de Los Tuxtlas.
En colaboración con el Instituto Veracruzano de Cultura inicia la creación del Museo de Historia Natural de Los Tuxtlas, en San Andrés Tuxtla, Veracruz.
(1991) En diciembre de 1991, Ernesto Rodríguez Luna recibió, de manos del Rector de la Universidad Veracruzana, Lic. Rafael Hernández Villalpando, y del Secretario Académico, Antrop. Félix Báez Jorge, el Reconocimiento al Mérito Universitario por su destacada labor en el Campo de la Investigación.
(1992) El 31 de julio, Ernesto Rodríguez Luna es nombrado Director del Instituto de Neuroetologia, de la Universidad Veracruzana.
El 14 de diciembre, Ernesto Rodríguez Luna es nombrado Director Académico del Patronato Pro-Universidad Veracruzana, A.C.
(1994) El 22 de Agosto, Ernesto Rodríguez Luna es nombrado Consejero Ex Oficio del Consejo Universitario de la Universidad Veracruzana.
(2001) El 26 de septiembre del 2001, Ernesto Rodríguez Luna es nombrado Director General del Área Académica Biológico-Agropecuaria de la Universidad Veracruzana.
(2007) El 16 de agosto, Ernesto Rodríguez Luna es nombrado como Coordinador del Centro de Investigaciones Tropicales de la Universidad Veracruzana.