En 1980 siendo Jefe del Área Técnica el Maestro Bonifacio C. A. Peña Pardo y Director de la Facultad de Ingeniería el Ing. Faustino Troncoso Olivares, se crea el «Instituto de Ingeniería», dentro de las instalaciones de la Facultad de Ingeniería pero con autonomía Académica y Administrativa, nombrando al Dr. José Luis Vargas López como encargado de su operación académica.
En 1982 se designa al M.I. Enrique Rodríguez Magaña como Jefe de Estudios Superiores y al Dr. José Luis Vargas López como secretario académico de la institución.
En ese mismo año se divide la Maestría de Ingeniería Eléctrica en dos programas: Potencia y Control con la especialidad en «Ingeniería Integral para los Sistemas de Agua Potable y Alcantarillado», producto de un convenio con la Secretaría de Recursos Hidráulicos, así como la especialidad de «Comercio y Operación Marítima».
En 1985, con el Maestro Bonifacio C. A. Peña Pardo como director (1984-1991), se inicia la construcción de las instalaciones del Instituto de Ingeniería en el Campus Mocambo, siendo secretario académico el Dr. Enrique A. Morales González, quien posteriormente fue director del Instituto de Ingeniería (1991-2000).
Edificio frontal, Campus Mocambo
Edificio posterior, Campus Mocambo
En 1988 se ofrece el programa de Maestría en Ciencias de la Computación, y en 1995 el Diplomado en Informática. En 1996, surge su primer programa de doctorado en «Ingeniería de Estructuras».
En abril del 2000 vuelve a ser reubicado , al ceder su espacio para la construcción de la USBI Veracruz, asignándole el edificio correspondiente a la Biblioteca Regional.
En 2001, como consecuencia de un replanteamiento en la oferta general de posgrados de la Universidad Veracruzana, se crea la Maestría en Ingeniería, programa de posgrado con un tronco común y cinco opciones terminales: Ambiental, Eléctrica (Control), Estructuras, Mecánica y Telecomunicaciones.
En Febrero de 2006, se nombra al M.I. Alberto Pedro Lorandi Medina, como director para el periodo 2006-2010.
En diciembre de 2007 se designa director interino al Dr. Enrique Augusto Martínez Martínez (2007-2009) .
El 23 de abril de 2009, es la Dra. María Estela Montes Carmona seleccionada como Directora (2009-2013), quien permanece en el cargo hasta 2021.
El 16 de enero de 2021, se elige al Dr. Ricardo Orozco Cruz para el periodo 2021 a 2024.
